Pain

Pain, no caso seu corpo principal, que é o corpo de Yahiko, foi treinado por Jiraya. Tobi é o fundador da Akatsuki e Pain é o líder.
Pain lidera uma das facções criminosas na guerra civil da Vila Oculta da Chuva. A guerra acaba quando Pain consegue derrotar Hanzou e mata todos que tinham relação com ele para apagar sua existência como punição divina. Pain se define como uma divindade. Com isso se torna o novo líder da Vila da Chuva.
Pain dá as ordens através de mensageiros, nunca foi visto pelos habitantes da vila, que só sabem onde ele reside.
Pain enfrenta Jiraya, seu professor, que invadiu a Vila da Chuva em busca de informações sobre o líder da Akatsuki. Nessa batalha Pain revela seu objetivo de capturar todos os Bijuus, ele planeja criar um Kinjutsu que acabará com um país em um só ataque, dizendo que esse é o jeito mais rápido de acabar com os conflitos, dar armas para as nações se destruírem instantaneamente, dizendo que as pessoas, os países o mundo ira conhecer a dor. Na luta Pain utiliza seus corpos para poder derrotar Jiraya. Jiraya reconhece dois rostos de Pain como sendo Yahiko e outro ninja com quem lutou antes e, percebendo que há um grande segredo com Pain, usa seus sapos para enviar um dos corpos de Pain para a Vila Oculta da Folha poder estudar. Após enviar os sapos, a luta se encerra e Pain mata Jiraya.
Pain caça e captura o Rokubi no Namekuji e ao se reunir com os outros membros da Akatsuki confirma que o Bijuu de oito caldas foi capturado por Sasuke e dado para Akatsuki. Assim, faltando apenas a Kyuubi, Pain, Konan e Tobi se apressam em invadir a Vila da Folha antes que eles decifrem as mensagens deixadas por Jiraya e descubram os segredos de Pain.